Bønder og skogsarbeidere satte fyr på hus i reservatet som ligger i landsbyen Manicore i den brasilianske delstaten Amazonas.
Tidligere ble medlemmer av Tenharim-stammen tvunget til å søke tilflukt i en nærliggende militærbase.
Urfolkene beskyldes av befolkningen i byene i nærheten for å ha bortført tre arbeidere for en uke siden. De tre forsvunne arbeiderne ble sist sett i nærheten av reservatet i byen Humaita.
Urfolksleder ble funnet drept
En lokal gruppe har bedt politiet om å gjennomføre et søk i urfolkenes område.
Gnisningene mellom ikke-urfolk og urfolk i Amazonas delstaten har økt den siste tiden etter at en Tenharim-leder nylig ble funnet drept.
Noen av ikke-urfolkene tror at Tenharim-stammen holder de tre savnede skjult som en hevn på at lederen deres ble drept.
Tidligere denne uka brant ikke-urfolk ned bygninger i urfolkslandsbyen og slåss med politiet.
Rundt 3000 mennesker protesterte i byen Humaita. Rundt 120 miliærpoliti prøvde å gjenopprette orden. Opprørspolitiet ble sendt til Humaita og den lokale politisjefen måtte be om hjelp fra en større politistyrke.
Sammenstøt mellom urfolksgrupper og lokale ikke-urfolk er ikke uvanlig i Brasil. Ofte bygges konfliktene på kampen om land, tømmerhuggong og gruverettigheter.