Dermed er hun med blant de 30 som skal kjempe om bonussekunder i finalene mandag ettermiddag.
Italienske Arianna Follis var raskest i prologen, 0,12 hundredeler foran Bjørgen.
Marthe Kristoffersen hadde femte beste tid, mens Astrid Uhrenholdt Jacobsen slet seg med til finalene som siste kvinne på 30.-plass.
Therese Johaug og Kristin Størmer Steira ble utslått. Johaug ble nummer 32 og Størmer Steira nummer 38.
Sprinten i Praha er den 3. etappen av årets Tour de Ski.