Med to drømmetreff av Tevez, samt en scoring av Jason Lescott, sikret klubben seg tre verdifulle poeng tirsdag.
Klubben hadde før kampen allerede sikret seg rett til mesterliga-kvalifiseringsspill.
Etter kveldens oppgjør passerer imidlertid laget Arsenal på 3. plass, noe som gir direkte innrykk i mesterligaen. City har 68 poeng, mens Arsenal har ett poeng mindre, idet det gjenstår en serierunde.
Nytt oppgjør
Finalistene fra FA-cupen møtte hverandre for andre gang på kun tre dager tirsdag. Sist gang var lørdag da
siden 70-tallet.Stoke fremstod likevel ikke som spesielt revansjevillige i kampen, og allerede etter 14 minutter hadde Carlos Tevez puttet inn 1-0.
Argentineren spilte først vegg med Milner før han avsluttet elegant med å sette ballen bak keeper Thomas Sørensen. Et lekkert mål av Citys storscorer.
Saken fortsetter under bildet
Kjempetreff av Tevez
2-0 kom etter 53 minutter ved Jason Lescott etter et City-frispark foran Stoke-buret.
Sørensen rykket ut på fem-seks meter, men feilberegnet situasjonen. Lescott greide dermed å være først på ballen med hodet, og satte inn Citys andre mål.
Etter 65 minutter viste så Carlos Tevez hvilken klassespiller han er da han satte inn Citys tredje mål i kampen - denne gangen på frispark.
Tevez fikk kjempetreff fra cirka 30 meters hold, og skrudde ballen elegant forbi en sjanseløs keeper.
Med tirsdagens scoringer tok han igjen Dimitar Berbatov
Begge har nå 21 mål.Carew startet
John Carew startet på topp for Stoke i seriekampen mot Manchester City, og ble byttet ut etter 72 minutter.
Carew har ikke startet en kamp for klubblaget siden 0-3-tapet for West Ham 5. mars.
City spiller nå borte mot Bolton i den siste serierunden i Premier League førstkommende søndag. Stoke møter Wigan.
Seier i siste runde vil garantere mesterligaspill for Roberto Mancinis disipler.