Nigeria sikret avansementet med 3-0 mot Mosambik i kveld.
Fra før var Egypt (uten poengtap) klar for cupspillet i samme gruppe.
Peter Odemwingie (45, 47) og Obafemi Martins (86) scoret for Nigeria, som var klart best.
Trøst for Egypt
Egypterne slo Benin 2-0 onsdag. Ahmed Al Muhammadi og Ahmed Raouf var målgjørere.
Med onsdagens kamp er Egypt ubeseiret i 15 kamper i afrikamesterskapet. Egypt kan ta sin tredje strake tittel i mesterskapet, og den sjuende totalt.
Det vil være en trøst etter at VM-plassen røk i omspill for noen måneder siden.