Beslutningen er i strid med FN-vedtak, sier alliansens politiske leder.
LES:
Bryter vedtak
Generalsekretær Jaap de Hoop Scheffer sa tirsdag at russerne med sin anerkjennelse bryter en rekke vedtak i FNs sikkerhetsråd.
Russland har selv gitt sin tilslutning til resolusjoner som fastslår at Georgias territoriale integritet er ukrenkelig, framholdt han.
Russlands ledere er ikke redd for reaksjonene.
– Vi frykter ikke noen ting, heller ikke utsiktene til en kald krig. Men vi ønsker det ikke, sa Russlands president Dmitrij Medvedev tirsdag.
Feiret i gatene
Sør-ossetere i hovedstaden Tskhinvali var i ettermiddag ute i gatene og feiret. Blant annet ved å fyre av hele magasiner med automatvåpen i lufta.
- Dette er den tradisjonelle måten å feire store begivenheter på i Kaukasus, rapporterer Morten Ruud fra Moskva.
Folk sier de har ventet 20 år på selvstendighet, og er veldig lykkelige. Også i Abkhasia blir det feiret.
Støre bekymret
USAs utenriksminister Condoleezza Rice beklaget Russlands beslutning, mens Frankrikes president Nicolas Sarkozy, som leder formannskapet i EU, fordømte den. Sveriges utenriksminister Carl Bildt sa i en skarp kommentar at Russland har valgt å trappe opp konflikten med omverdenen.
Utenriksminister Jonas Gahr Støre beklager også Russlands beslutning, som han sier bryter med FNs prinsipper om territoriell integritet.
– Jeg er bekymret for de videre regionale og internasjonale konsekvenser det russiske vedtaket kan få, sier Støre.
FNs generalsekretær Jaap de Hoop Scheffer sier Russlands handlinger «reiser tvil om Russland er forpliktet til fred og sikkerhet i Kaukasus.»
- Annektering
Georgia kalte Russlands anerkjennelse en annektering av de to territoriene.
– Dette er det første forsøket i Europa på å tvinge en nabostat i kne og forandre Europas grenser med makt siden Nazi-Tyskland og det stalinistiske Sovjetunionen, sa den georgiske presidenten Mikhail Saakasjvili.
Russland hevder beslutningen var nødvendig for å spare liv i de to regionene, der separatister har ligget i konflikt med georgiske styresmakter.
Medvedev gjorde det klart at Russland vil «beskytte» Abkhasia og Sør-Ossetia mot mulige angrep.
– Russland er en stat som må sikre interessene langs hele sin grense, erklærte Medvedev tirsdag.
Samtidig stilte en russisk toppgeneral spørsmål ved NATOs aktiviteter i Svartehavet, som han mente lå på et «ekstremt høyt nivå».
Reiser tvil
Russernes handlinger i de urolige regionene reiser tvil om hvorvidt lederne i Kreml virkelig føler seg forpliktet til å fremme fred og sikkerhet i Kaukasus, fortsatte Scheffer.
Georgia ønsker medlemskap i NATO for å sikre seg bedre mot russiske angrep.
