Ifølge nyhetsbyrået AP ble 15 personer funnet døde i en landsby ved foten av vulkanen.
Tidligere tirsdag døde en tre måneder gammel baby etter at den fikk pusteproblemer som følge av askeskyen.
Talsmann for Panti Nugroho-sykehuset, Agustinus Parjo, opplyser at tre personer døde av brannskadene de fikk som følge av askeskyen fra Merapi.
Innbyggere nær vulkanen, som ennå ikke har forlatt hjemmene sine, risikerer å dø dersom de ikke evakuerer, opplyser indonesiske myndigheter.
Buldret i 15 minutter
Sjefsvulkanolog Subandriyo sier at utbruddene startet rundt klokken 18 lokal tid tirsdag, etter at vulkanen Merapi hadde buldret faretruende i flere timer.
– Det var en voldsom buldring som varte en god stund, kanskje i 15 minutter, sier han til nyhetsbyrået AFP.
– Deretter begynte enorme mengder aske å velte ut og opp i luften, sier Sukamto, en bonde som fremdeles holdt stand i hjemmet sitt ved foten av vulkanen.
- Les også:
Flyktet i panikk
Tusenvis av mennesker flyktet i panikk da utbruddene startet ved 18-tiden tirsdag kveld. Flere av menneskene var blitt dekket av et hvitt lag med aske. Representanter for myndighetene hjalp innbyggerne å rømme området.
– Vi hørte tre eksplosjoner rundt klokken 18, aske ble spydd rundt 1,5 kilometer opp i luften og sendte varmebølger nedover fjellsidene, sier vulkanologen Surondo til AFP.
Ifølge AFP har minst 24 personer fått behandling for pusteproblemer. Flere har også fått behandling for brannskader ved Sarjitosykehuset i Yogyakarta.
Redningsmannskaper forteller at flere personer kan være fanget inne i området ved foten av vulkanen på grunn av at en rekke trær har falt over ende og sperrer veiene.
- Les også:
Tvangsevakuert
Rundt 11.400 innbyggere som bor ved foten av Merapi er sterkt oppfordret til å evakuere.
De som bor innenfor en radius på sju kilometer fra vulkanens krater er blitt tvunget til å evakuere av myndighetene.
Vulkanforskere advarer om at trykket som bygger seg opp i vulkanen Merapi på øya Java i Indonesia nå kan føre til et av de kraftigste vulkanutbruddene på mange år.
«Merapi» hadde sist utbrudd i 2006, og da mistet to mennesker livet. Et langt større utbrudd skjedde i 1994, da 70 mennesker omkom.
Det kraftigste utbruddet i moderne tid var i 1930, da 1300 menneskeliv gikk tapt.