President Chen Shui-bian ledet an da demonstrantene marsjerte og ropte nasjonalistiske slagord i havnebyen Kaohsiung.
Arrangørene hevdet at så mange som 300.000 deltok, men politiet anslo at antallet var i underkant av 150.000. Mange hadde på seg grønne pannebånd og grønne vester mens de viftet med grønne flagg.
Noen hadde også tatt med seg hele familien, inkludert kjæledegger, i den karnevalslignende demonstrasjonen.
– Er det noe galt med at vi blir med i FN? De 23 millioner innbyggerne i Taiwan er også mennesker og burde ha like rettigheter som folk i andre land, sa Chen da han talte til folkemassene.
Taiwan er fortsatt formelt en del av Kina. Taiwans ønske om å bli FN-medlem kommer trolig til å bli avvist på grunn av kinesisk motstand når FNs hovedforsamling åpner tirsdag.