Chris Layman, en talsmann for Pentagon, sier det foreløpig ikke er kjent hvem som avfyrte skuddene, skriver CNN.
Det er ikke meldt om personskader, og det er heller ikke meldt om større skader på bygningen, melder nyhetsbyrået Reuters.
Amerikanske myndigheter tror skuddene kan være en «tilfeldig hendelse».
– Vi undersøker alle muligheter. Dette ser ut til å være en isolert hendelse så langt, sier sjefen for sikkerheten ved Det amerikanske forsvarsdepartementet, Steven E. Calvery.
Fem skudd
Litt før klokken 11 (norsk tid) hørte politiet minst fem skudd, ifølge Layman. Bygnigningen, og en parkeringsplass, ble sperret av i 40 minutter.
En annen talsmann for Pentagon, Terry Sutherland, sier at to kuler traff bygningens sørside. Én av kulene streifet et vindu, og den andre kulen traff selve bygningen.
I mars skjøt og skadet en mann to sikkerhetsvakter utenfor Pentagon. Hendelsen førte til en omfattende gjennomgang av sikkerheten ved forsvarsdepartementet.
Militærpolitiet etterforsker hendelsen.
