Airbus-flyet, som hadde 183 passasjerer og en besetning på 12, har fått klarering til gjenoppta ferden til Athen.
Flyet var på vei fra New York til den greske hovedstaden, da det ble omdirikgert til å lande i Shannon, sørvest i Irland.
Klokken var rundt 5.20.
En mann som snakket engelsk med arabisk aksent hadde ringt to ganger til flyplassen i Athen for å advare om en planlagt bombeaksjon.
Han knytter trusselen til henrettelsen av Saddam Hussein.
Alle om bord ble evakuert mens sikkerhetsfolk gjennomsøkte flyet.
- Klarsignalet kom klokken 11.30. Nå skal flyet taues, passasjerne skal bli sluppet på igjen og komme seg videre, sier en talsmann for flyplassen.