Fabrikkene hadde kapasitet til å produsere 100 tonn kokain årlig, ifølge lederen av landets antinarkotikapoliti.
Operasjonen ble gjennomført over fem dager og er en del av regjeringens strategi som fokuserer på å bekjempe narkotikaproduksjon samt dyrking av kokabusker, som er hovedingrediensen i kokain, skriver nyhetsbyrået Reuters.
– Dette er et viktig slag mot økonomien til narkotikahandelen, sier direktør for anti-narkotika politiet, generelt Jose Angel Mendoza til Reuters i jungelen i Guaviare provinsen.
Laboratoriene ble brent ned av politiets kommandosoldater.
Kokadyrkingen gikk opp med 39 prosent i Colombia i 2015, ifølge tall fra FN. Politiet beslagla 253 tonn kokain i Colombia i 2015, det er en økning på 71 prosent fra året før.
Både venstreorienterte opprørere og kriminelle gjenger er involvert i narkotikahandelen. De både skattlegger kokadyrkerne, driver produksjonslaboratorier og smugler narkotika i samarbeid med karteller fra Mexico.
- Les også