Det bekrefter en myndighetsperson til nyhetsbyrået AFP.
Asadullah Khalid befant seg i hus i Kabul hvor han skulle ta imot en gjest.
Khalid pådro seg skader i underkroppen da bomben gikk av. Han ble fraktet til sykehus for blodoverføring.
Tilstanden er foreløpig ikke kjent, men en vestlig diplomat sier til AFP at han er alvorlig skadet.
Khalid ble utnevnt til etterretningssjef av president Hamid Karzai i august i år, til tross for kraftig kritikk fra vestlige menneskerettighetsorganisasjoner.
Ifølge Amnesty har det kommet påstander om at Khalid har vært involvert i en rekke angivelige tortursaker og andre menneskerettighetsbrudd.
Khalid er en sterk motstander av Taliban og har et nært forhold til Karzai-familien.
