På sitt dødsleie beskyldte eks-spionen Aleksandr Litvinenko Russlands regjering for å stå bak forgiftningen.
Ifølge avisen The Sunday Times skal Storbritannias utenriksminister Margaret Beckett i et regjeringsmøte ha fortalt at Russland reagerte kraftig på at Litvinenkos beskyldninger kom ut.
Lavrov avviser at Kreml skal ha ytret ønske om at Litvinenko ble kneblet.
- Unngå politisering
Den russiske utenriksministeren deltar i dag på et møte mellom utenriksministre i Brüssel i regi av Organisasjonen for samarbeid og sikkerhet i Europa (OSSE).
- Denne saken er selvfølgelig skadelig for våre relasjoner, sa Lavrov under besøket.
Han mener Litvinenko-saken har kommet helt ut av proporsjoner ved at russiske tjenestemenn blir beskyldt for å stå bak forgiftningen.
- Det eneste vi snakker om nå er nødvendigheten av å unngå en politisering av denne saken, denne tragedien, sa Lavrov til nyhetsbyrået ITAR-TASS.
Litvinenko ble forgiftet med det radioaktive stoffet polonium 210. Før han døde, beskyldte han Russlands president Vladimir Putin for å stå bak forgiftningen.
Britisk politi forbereder seg nå på å reise til Moskva for å foreta videre undersøkelser rundt Litvinekos dødsfall.