Hjemmelaget trengte en omgang på å skåre mot gjestene fra Alta. To minutter etter hvilen skallet Mikael Dorsin et hjørnespark i mål og sørget for 1-0 til RBK.
Deretter var det landsmannen Mikael Lustigs tur, fra ti-tolv meter satte han ballen i mål.
Et kvarter før full tid kom Alta tilbake, innbytter Aldin Softic utnyttet slurv i RBK-forsvaret og reduserte til 2-1.
Men Rosenborg var sterkest på Lerkendal, Per Ciljan Skjelbred økte ledelsen til 3-1 seks minutter før kampslutt.
Dermed er trønderne klare for fjerde runde i cupen. Neste motstander er Sandefjord. Kampen spilles 7. juli.