Sundbys frafall ble offentliggjort i en pressemelding fra Norges Skiforbund like før klokken 11.00 torsdag.
Landslagslege Knut Gabrielsen bekrefter frafallet overfor NRK.no.
– Han er litt sår i brystet. Han er i bedring, men kommer ikke til å gå stafetten, sier Gabrielsen til NRK.no.
– Tok avgjørelsen selv
Sundby tok VM-sølv på skiathlon-øvelsen forrige helg, og var favoritt til å få gå tredje etappe på det norske stafettlaget dersom han følte seg frisk nok.
Torsdag morgen gjorde landslagsslegen en ny vurdering, der Sundby skal selv ha tatt avgjørelsen om å stå over.
– Han tok avgjørelsen selv. Han mener vel at i den formen han er nå, så er det andre som kan gjøre en bedre jobb for laget. Det er en voksen avgjørelse, sier Gabrielsen.
Har vært syk siden VM-sølvet
Johnsrud Sundby ble syk tirsdag og har vært isolert fra troppen siden. Han gikk også glipp av onsdagens 15-kilometer.
Der ble han erstattet av Tord Asle Gjerdalen som tok en overraskende VM-bronse. Gjerdalen erstatter mest sannsynlig Sundby på stafetten også.
Dermed blir trolig det norske laget bestående av Eldar Rønning, Tord Asle Gjerdalen, Sjur Røthe og Petter Northug, men det er ikke klart hvem som går de forskjellige etappene.
Laget blir offentliggjort torsdag ettermiddag.