Ambassadør Jamal Al Jamal døde på et sykehus i Praha onsdag ettermiddag, noen timer etter eksplosjonen i hjemmet hans.
Eksplosjonen som drepte den 56 år gamle ambassadøren skjedde da han åpnet en safe som ikke hadde vært åpnet på minst 30 år.
Den palestinske utenriksministeren Riad Malki sier at det ikke er noe som tyder på noe kriminelt i forbindelse med eksplosjonen.
Ifølge utenriksministeren var safen nylig flyttet til residensen fra en tidligere ambassadebygning.
– Ambassadøren bestemte seg for å åpne den. Etter at han åpnet den, skjedde det noe inne i den og den gikk av, sier utenriksminister Malki til nyhetsbyrået Ap.
Talskvinne for politiet i Praha, Andrea Zoulova, sier at safen trolig var rigget for å eksplodere om noen åpnet den.
Jamal Al Jamal hadde nettopp flyttet inn i residensen sammen med sin familie.
Kan komme fra PLO-kontor
Det er ikke kommet frem hvordan utenriksministeren vet at safen ikke var blitt åpnet på 30 år, eller hvor safen var sist den ble åpnet.
– Safen hadde stått i et hjørne i den gamle ambassadebygningen uten at noen brydde seg. Ingen hadde rørt den på 20–25 år, sier utenriksminister Malki.
Den palestinske bevegelsen PLO hadde under den kalde krigen kontorer i flere av Østblokklandene, og nyhetsbyrået Ap skriver at safen kan stamme fra et slikt kontor.
Ambassadøren ble kjørt til sykehus etter eksplosjonen og lagt i et kunstig koma, men døde etter noen timer.