Det israelske militæret har bekreftet at fire mennesker ble drept under aksjonen.
Den ene var Hamza Abu Alhija, et medlem av Hamas' væpnede fløy, og som israelske soldater var kommet for å pågripe i en bolig.
24 år gamle Hamza Abu Alhija var mistenkt for å ha deltatt i angrep mot israelere, ifølge det israelske militæret.
Eieren av huset i Jenin der Alhiha gjemte seg sier at de israelske soldatene kom til huset klokken 02.00 i natt.
– Det var skyting i huset i en halv time, og så kom soldatene og beordret oss ut, sier 67 år gamle Azmi Husniya til nyhetsbyrået Reuters.
Han sier at han så Alhija hoppe ut av vinduet i et forsøk på å flykte. To av 67-åringens sønner skal ha blitt såret i aksjonen.
To israelske soldater ble såret idet soldatene ble beskutt under aksjonen, opplyser militære kilder.
- Les også:
Artikkelen fortsetter under bildet.
Liket av Hamza Abu Alhija ble båret gjennom gatene i flyktningleiren Jenin lørdag morgen.
Foto: Mohamad Torokman / ReutersBle angrepet av rasende folkemengde
Etter skytingen løp innbyggerne i flyktningleiren Jenin ut på gatene og begynte å kaste stein og brannbomber mot soldatene.
Det førte til at israelske soldater begynte å skyte mot innbyggere og tre palestinere ble drept.
Minst en av de drepte var en sivil person, opplyser palestinske helsearbeidere og sikkerhetskilder. De sier også at ytterligere 14 palestinere ble såret i raidet.
Tilstanden for to av dem skal være kritisk. Røde Halvmåne oppgir at ti personer ble såret, hvorav en har kritiske skader.
Spent på Vestbredden
Kampene er noen av de verste som har funnet sted i Jenin siden israelske styrker gikk inn i flyktningleiren Jenin i 2002.
Raidet har utløst raseri blant Hamas-tilhengere i området, og da de døde ble båret fram i gatene for å bli gravlagt lørdag, ropte folk slagord mot Palestinas president Mahmoud Abbas, som er involvert i fredssamtaler med Israel.
Hamas, som styrer på Gazastripen, det andre palestinske territoriet, ønsker ikke fredsforhandlinger med Israel.
Palestinske myndigheter sier at før dagens skyting var 57 palestinere drept og nesten 900 såret av israelere siden fredsforhandlingene startet opp igjen i juli i fjor.
Senest for tre dager siden ble en palestinsk gutt drept i et annet område på Vestbredden.
