Det fant sted harde sammenstøt ved flere valglokaler, og øyenvitner forteller at politiet brukte tåregass mot velgere i Nildeltaet og i Qena.
Valgkampen er blitt dominert av myndighetenes angrep på den islamistiske opposisjonen. Det er rettet en rekke anklager mot regjeringen for å hindre opposisjonen å drive valgkamp.
Les også:
Valgdagen skal flere medlemmer av det forbudte Muslimsk brorskap ha blitt såret i sammenstøt med politiet.
Uroen fant sted til tross for skjerpet sikkerhet i forbindelse med valget. Det var utplassert opprørspoliti flere steder.
Les:
– Valgfusk og trakassering
Opposisjonspolitikere sier de har samlet bevis for valgfusk og trakassering, og egyptiske observatører sier det var flere uregelmessigheter helt fra starten av valgavviklingen.
Det regjerende Nasjonaldemokratiske partiet til president Hosni Mubarak ventes å vinne et solid flertall av de 508 valgte plassene i nasjonalforsamlingen.
Det vil bli ytterligere styrket når presidenten utnevner sine medlemmer av de ti plassene som er forbeholdt ham å bestemme over.
Valglokalene stengte søndag ettermiddag, og de første resultatene er ventet å bli offentliggjort mandag.