Studentene hadde fått beskjed på forhånd om å ta med seg pappeskene til eksamenen sist onsdag, skriver CNN.
De hadde skåret ut hull på en side av eskene, slik at de kunne se rett frem, men ikke titte bort på studentene ved siden av seg.
Eskene ble tatt i bruk etter at det i fjor hadde vært omfattende juks på høyskolen.
Behandles som dyr
Saken ble kjent etter at en ansatt på skolen tok bilder av elevene som ble lagt ut på Facebook.
Bildene vakte stor oppmerksomhet og skolen ble kraftig kritisert, også av myndighetene.
Utdanningsminister i delstaten Bihar, S. Suresh Kumar, skrev på Twitter at «ingen har lov til å behandle studenter som dyr».
Sier det var frivillig
Høyskolen har svart på kritikken ved å si at det var frivillig å bruke eskene. Ifølge skolen var det 56 av de totalt 72 studentene som tok eksamen sist onsdag, som brukte eskene.
De kaller bruken av eskene for ett eksperiment og sier at studentene ble bedt om å ta av eskene etter en time.
Skolen har nå sendt en skriftlig forklaring og en unnskyldning til myndighetene, ifølge skolens administrative leder, M.B. Sateesh.
Spørsmålet er om det er nok. Ifølge Telegraph India kan delstatsmyndighetene komme til ta fra høyskolen lisensen, noe som vil føre til at den blir nedlagt.
Arresterte hundrevis i 2015
Juks under eksamener er et utbredd problem i India og har foregått i en årrekke.
I mars 2015 gikk bilder av foreldre og venner av elever på en skole i Bihar verden rundt.
Foreldrene og elevene hadde klatret opp på skolebygningen for å hjelpe elevene som hadde eksamen på innsiden.
Elevene ble observert mens de kopierte svar fra ark som var smuglet inn til dem gjennom vinduene.
Ifølge BBC ble rundt 300 personer arrestert i etterkant av avsløringene den gangen, mens minst 750 elever ble utvist fra skolen.
Kjemper om plasser på universitetene
Juksingen på prøvene skyldes ifølge Financial Times kamp om de 600.000 plassene på landets offentlige universiteter.
The Guardian skriver at India har utviklet det som kalles en «jukse-mafia» som tjener store penger på desperate foreldre og elever.
Resultatet er at de som får best karakter, til tider viser seg å være nærmest totalt kunnskapsløse.
For tre år siden ble en 17 år gammel jente, som hadde fått delstatens beste karakter i Bihar, arrestert av politiet, skriver Guardian.
Grunnen til arrestasjonen var at hun under et TV-program sa at hun trodde at «statsvitenskap» handlet om å lage mat.