Mohamad Reza Khatami, presidentens bror, er blant de avviste. Han er visepresident i nasjonalforsamlingen og leder et reformorientert parti.
Også den ledende reformisten Mohsen Mirdamadi, leder for utenrikskomiteen i nasjonalforsamlingen, er avvist.
– Jeg oppfatter denne beslutningen som et ulovlig statskupp og et ikke-militært forsøk på regimeskifte, sier Mirdamadi.
AVVISER: Det konservative rådet av islamske lærde og rådets leder, ayatolla Ahmad Jannati, har avvist flere hundre iranske reformister fra det forestående valget. (Foto: REUTERS/Raheb Homavandi)
Halvparten av kandidatene som ønsket å stille i hovedstaden Teheran, ble ikke godkjent.
– Jeg beklager denne massive avvisningen av krefter innenfor nasjonalforsamlingen og personligheter utenfor forsamlingen, sa presidenten i nasjonalforsamlingen, Mehdi Karoubi, som selv ikke er blant de avviste.
Han sa også at han er i kontakt med president Khatami, vokterrådet og Irans åndelige leder ayatolla Ali Khameini om krisen, og at han hadde advart dem mot omfattende folkelig uro i forkant av valget dersom vedtaket ikke omgjøres.
Rådets vedtak må godkjennes av Iransk åndelige leder, ayatolla Ali Khamenei.
De fleste av de reformvennlige representantene i nasjonalforsamlingen i Iran la ned arbeidet sitt i protest mot vedtaket.
Noen reformorienterte partier truer med å boikotte valget 20.februar hvis for mange kandidater utestenges.
Reformpolitikerne varsler også at de vil arrangere en sit-in-demonstrasjon i nasjonalforsamlingen søndag kveld, og at bygningen vil bli gjort til et senter for motstand mot beslutningen.