Merkel er i Russland for første gang på to år, og ble tatt imot på Putins landsted i Sotsji ved Svartehavet i ettermiddag.
Det var på forhånd ventet at de to lederne skulle snakke om vanskelige saker.
– Vi må bruke denne muligheten til å snakke om bilaterale relasjoner og vanskelige saker som Ukraina, Syria og kanskje noen andre regioner, sa Putin da han tok imot den tyske statsministeren.
Ukraina-konflikten
Møtet Merkel og Putin var delt i to. Første halvdel handlet i hovedsak om Ukraina-konflikten.
Merkel påpekte at hun er lite tilfreds med samarbeidet mellom Tyskland, Russland, Ukraina og Frankrike i Ukraina-konflikten.
– Vi har ulikt syn på hva som er årsaken til konflikten, sa Merkel.
Hun mener alle parter ønsker å hindre videre eskalering av konflikten og at samarbeidet mellom de fire landene har bidratt til å dempe konfliktnivået.
- Les også:
Tok opp situasjonen for homofile
Merkel og Putin fikk også tid til andre temaer under møtets første halvdel. Merkel tok opp situasjonen for homofile i Tsjetsjenia og ba Putin gripe inn.
– Vi har fått negative meldinger om måten homofile er blitt behandlet i Tsjetsjenia på. Jeg ba Putin spesifikt om å bruke sin innflytelse til å bedre forholdene for homofile, sa Merkel på en felles pressekonferanse de to hadde etter at denne delen av møtet var over.
Merkel, som omtalte samtalene med Putin som konstruktive, nevnte også konkret situasjonen for Jehovas vitner, som nylig ble forbudt av russisk høyesterett.
IKKE FORNØYD: Merkel sa hun ikke er fornøyd med samarbeidet i Ukraina-konflikten, men at samarbeidet likevel er den beste måten å diskutere Øst-Ukraina på.
Foto: Alexander Zemlianichenko / APAvviser valg-innblanding
Putin avviste at Russland blandet seg inn i fjorårets presidentvalg i USA.
– Slike beskyldninger er ikke annet enn rykter som blir brukt som del av en innenrikspolitisk kamp i USA, sa Putin.
Han avviste også at Russland har blandet seg inn i europeiske valg.
Merkel sa at hun i samtalene la vekt på retten til å demonstrere i et sivilt samfunn. Putin skrøt på sin side av landets politistyrke:
– I motsetning til i enkelte andre europeiske land, der politiet tar i bruk tåregass under demonstrasjoner, utøver russisk politi en mer tilbakeholden og liberal rolle.
- Les også:
G20
G20 skal være hovedtema under møtets andre halvdel tirsdag ettermiddag. I forkant av G20-toppmøtet i Hamburg 7. og 8. juli har Merkel planlagt å møte alle lederne i de 20 landene.
Den tyske statsministeren har ikke vært i Russland siden 2015, og det én dag lange møtet tolkes som et tegn på at forholdet mellom Tyskland og Russland nå er på bedringens vei.
Merkels reise til Russland ble planlagt etter at Putin ba om «full normalisering» av forholdet mellom de to landene da han møtte Tysklands utenriksminister Sigmar Gabriel i mars.
- Les også: