To personer skal være kritisk skadet etter ulykka, ifølge politiet.
De forteller at mange av passasjerene var så skadet at de måtte transporteres i land på bårer. De skadde lå spredt rundt på havneområdet, omgitt av hjelpearbeidere.
– Folk var hysteriske
Flere av de skadde passasjerene befant seg på dekk i påvente av å gå i land da ferja kolliderte rundt klokka 09, lokal tid.
– Det gikk et rykk i båten, og folk ble slengt framover i setene og i veggene, sier lederen av ferjefirmaet SeaStreak, James Barker, til NBC4 New York.
En av passasjerene, Ellen Foran, sier til nyhetsbyrået at passasjerene ble liggende i en haug da det smalt.
– Vi bare falt oppå hverandre. Jeg ble slengt inni alle andre ... folk var hysteriske, sier Foran.
Kollisjonen var så kraftig at det ene hjørnet av båten ble revet opp til et stort hull.
Dee Wertz, som stod og ventet på land, så ulykka idet den skjedde.
– Ferjas høyreside traff kaia hardt, som en bombe, sier Wertz til Ap.
Pendlerferje mellom nabostatene
Det var ferja «Seasteak Wall Street» som kjørte inn i brygga på nedre Manhattan.
Fartøyet skal ha hatt 326 passasjerer om bord, ifølge New York Post.
Vitner forteller at kapteinen kjørte for raskt da båten nærmet seg kaia, men offentlige myndigheter har så langt ikke sagt noe om årsaken til ulykka.
Ferja var på vei fra nabostaten New Jersey til det finansielle distriktet i New York, da ulykken skjedde. Mange bruker denne ferja til å pendle til og fra jobb.