Redde sivile gjemmer seg i Beit Jala, hvor kampene fortsetter til tross for våpenhvilen som er inngått.
Både på Vestbredden og på Gaza-stripen var det onsdag kveld kamper mellom palestinere og israelere.
Tidligere onsdag ble det kjent at palestinernes leder Yasir Arafat og Ariel Sharon, statsministeren i Israel, hadde blitt enige om en våpenhvileavtale for Beit Jala og den israelske enklaven Gilo.
Dersom palestinerne sluttet å angripe Gilo, ville Israel trekke ut soldatene som har okkupert Beit Jala siden tirsdag morgen.
Onsdag kveld gjenopptok imidlertid palestinerne beskytingen av Gilo, og senere på kvelden spredte kampene seg til selve Beit Jala.
I følge nyhetsbyrået Reuters var noen av de som skjøt mot de israelske soldatene kledt i uniformen til de palestinske sikkerhetsstyrkene.
Kilder i EU har sagt at avtalen går ut å at den israelske hæren skal trekke seg ut av Beit Jala senest ved soloppgang torsdag, dersom skytingen har opphørt.
USAs utenriksminister Colin Powel ringte onsdag til Yasir Arafat for å be ham fortsette samarbeidet med Israel og gjøre mer for å få slutt på volden.
FNs generalsekretær Kofi Annan har bedt Israel om å trekke seg ut av Beit Jala og andre palestinske territorier, fordi han mener det er et viktig skritt i retning av å unngå en videre opptrapping av konflikten.
I løpet av onsdagen ble mist fire palestinere og en israeler drept i kampene. Dermed har 544 palestinere og 156 israelere måttet bøte med livet siden det palestinske opprøret startet for 11 måneder siden.