Ifølge en talsmann for myndighetene i Astrakhan-provinsen skyldtes eksplosjonen en ulykke og ikke et terrorangrep.
Ulykken inntraff tirsdag ettermiddag da gammel ammunisjon ble fraktet ut fra depotet for å bli destruert.
Eksplosjoner i ammunisjonslagre har rammet den russiske hæren flere ganger, og den anklages hyppig for å være uoppmerksom og ikke følge regelverket.
Senest i juni ble to personer drept og over 40 skadd da det begynte å brenne i et våpenlager like utenfor Moskva.
- LES OGSÅ: Brann i russisk ammunisjonslager