Masood ble drept i et attentat for ett år siden, og Karzais besøk ved graven til den tidligere lederen for Nordalliansen var preget av omfattende sikkerhetstiltak.
For bare to dager siden ble Karzai selv utsatt for et drapsforsøk i Kandahar, som han så vidt slapp unna.
Etter å ha lagt ned blomster og en bok på det grønne skrinet ved graven, ble Karzai fløyet vekk med helikopter.
Afghanistan kommer til å markere årsdagen for drapet på Masood mandag. Det er ventet seremonier over hele landet til minne om "Løven fra Panjsher". Karzai reiser til USA søndag eller mandag for å være med på minnedagen for 11. september i New York.