Briten kom til mål på samme tid som etappevinner Simon Špilak fra Slovenia. Alle andre i feltet ble slått med mer enn ett minutt.
Sammenlagt er Froome 47 sekunder foran Spilak før den 18 kilometer lange etappen som avslutter rittet søndag.
Snøvær, kulde og dårlig sikt medførte at den ene av to planlagte bestigninger av Col de la Croix måtte avlyses lørdag. Etappen var uansett rittets tøffeste.
Gabriel Rasch sto av lørdag etter å ha gjort en jobb som hjelperytter for Froome på de første etappene.
Froomes ledelse virket i fare da «nestkommanderende» Richie Porte ble kjørt av lørdag, og Sky-kapteinen satt isolert med sine tøffeste konkurrenter rundt seg. Han viste seg oppgaven moden og tråkket inn til en sterk 2.-plass.
Froome er favoritt på søndagens tempoetappe og storfavoritt til å vinne rittet sammenlagt.