Santini tar over etter Guy Roux som søndag sluttet etter 44 år som trener i Auxerre.
Auxerre ble nummer åtte i ligaen i år, men kvalifiserte seg for UEFA-cupen gjennom seieren i den franske cupfinalen sist helg.
Jacques Santini (Foto: Reuters/Scanpix)
Det blir den første trenerjobben for Santini siden han overraskende sluttet i Tottenham etter bare fire måneder i jobben.
Han oppga personlige grunner da han sluttet i Tottenham i november i fjor.
Landslaget
Santini har tidligere også trent det franske landslaget.
Under hans ledelse vant Frankrike Confederations Cup i 2003, men han trakk seg etter at laget ble slått ut av Hellas i kvartfinalen i EM i fjor.
Som klubbtrener var hans største øyeblikk da han trente Lyon til seriegull i Frankrike for fire sesonger siden.