Henry fikk ballen i midtsirkelen og tok seg forbi fire Real Madrid-spillere med et sololøp som ble avsluttet med
venstrebeinsskudd forbi keeper Iker Casillas i lengste hjørne.
Det satte 4000 Arsenal-tilhengere i lykkerus og fikk resten av fullsatte Bernabeu til å tie helt stille.
- Det var et fantastisk mål, verdig en stor spiller, skrøt
Casillas av sin motspiller etter kampen.
Scoringen i begynnelsen av annen omgang var fullt fortjent. Et Arsenal-lag som har vist råtten form i hjemlig serie, og som var svekket av skader, tok kommandoen og skapte tre sjanser bare det første kvarteret.
Laget forsvarte seg også strålende mot et Real-lag som slet med å skape sjanser, og kunne kontret inn flere mål mot slutten.
Jose Antonio Reyes og Fredrik Ljungberg var nær scoring i
starten, innbytterne Abou Diaby og Robert Pires misset
kontringssjanser mot slutten.
Fortjent seier
Real Madrid hadde ballen mye, men skapte lite. Laget ropte på straffe to ganger i annen omgang, men dommeren sa nei.
Raul ble den andre spiller som har rundet 100 mesterligakamper da han kom inn for Robinho i 2. omgang, men heller ikke turneringens mestscorende spiller noensinne (51 mål) greide å lure Arsenal-forsvaret tirsdag.
- Vi fortjente virkelig denne seieren. Vi kjempet om hver ball og skapte de største sjansene, sa Cesc Fabregas.
Real måtte tåle sitt første hjemmetap i europacupen på 19 kamper siden oktober 2002. Det var også klubbens første hjemmetap mot engelsk motstand noensinne.