City var i ledelsen både 1-0 og 2-1. Nedum Onuhoa gav dem ledelsen før pause.
Ailton Jose Almeida utliknet, men Steven Ireland sendte City foran på nytt.
Ståle Solbakkens elever utliknet da bare sekunder gjenstod, Martin Vingard var målscorer.
Det spørs nok likevel om ikke engelskmennene har det beste utgangspunktet foran returen i Manchester i neste uke.
Det andre engelske laget som var i aksjon torsdag, Tottenham, kom ikke like godt fra det. De gjestet Sjakhtar Donetsk og tapte 0-2. Det ukrainske laget har dermed et godt utgangspunkt foran returkampen i London.