De tre NATO-soldatene ble drept i bombeeksplosjoner i de sørlige delene av Afghanistan, skriver den NATO-ledede ISAF-styrken i en pressemelding.
I alt 339 utenlandske soldater er drept i Afghanistan hittil i år.
De seks afghanske soldatene ble drept i et NATO-angrep som var ment å være rettet mot Taliban-opprørere i Ghazni, sentralt i Afghanistan.
– Angrepet traff feilaktig en militærstasjon, og seks afghanske soldater ble drept. Vil kommer til å etterforske hendelsen, sier Nawruz Ali Mohamoodzada i det afghanske politiet, ifølge nyhetsbyrået AFP.
NATO har foreløpig ikke kommentert dette.
USA og NATO har om lag 140.000 soldater i landet, og i løpet av de kommende ukene øker antallet med 10.000.