Hele 80 prosent av dem som stemte fredag ga sin tilslutning til at Tsjekkia skal bli medlem av EU fra mai neste år.
Dersom 80 prosent av velgerne sier ja til medlemskap er det en langt høyere ja-prosent enn det som var forventet på forhånd.
Lørdagens måling, som er foretatt av instituttet SC & C, viser at valgdeltakelsen har vært på rundt 57 prosent.
Tidligere har Ungarn, Litauen, Malta, Polen, Slovakia og Slovenia sagt ja til EU-medlemskap i folkeavstemninger.