I alt 19 mistenkte skal avhøres om sin rolle og tilknytning til militsgruppene, som fortsatt sprer frykt fra sine baser på Vest-Timor.
De tre generalene som mistenkes for å ha trukket i trådene, og som nå skal avhøres, er regjeringshærens tidligere øverstkommanderende i regionen, general Adam Damiri, tidligere øverstkommanderende på Øst-Timor, general Tono Suratman og tidligere politisjef i det okkuperte området, general Timbul Silaen. Den tidligere forsvarssjefen, general Wiranto, er ikke blant de tre generalene som skal avhøres.
Indonesia har vært under sterkt internasjonalt press for å straffeforfølge de ansvarlige for volden. Ifølge uavhengige menneskerettsorganisasjoner ble volden i stor grad organisert av landets regjeringshær.
Indonesia invaderte den tidligere portugisiske kolonien Øst-Timor i 1975, og okkuperte området til høsten 1999 da en FN-styrke rykket inn.