Gisseldramaet begynte da mannen stormet inn i banken torsdag ettermiddag, bevæpnet med en kniv.
Det ene av de fem gislene var en kunde, mens de fire andre var på jobb i Shinkin Credit Bank, som ligger i byen Toyokawa.
Krevde statsministerens avgang
Mannen krevde først sigaretter, mat og en megafon. Lenge prøvde politiet å overtale mannen til å gi seg, men situasjonen lot seg ikke løse.
Men i 21-tiden slapp mannen slapp fri det ene gisselet i bytte mot mat.
Deretter skal mannen ha krevd statsminister Yoshihiko Nodas avgang.
– Jeg vil at Noda gir seg. Jeg vil uttrykke mine egne tanker, skal gisseltakeren ha sagt.
Politiet opprettholdt hele tiden en dialog med mannen mens de prøvde å finne ut akkurat hvor i bygget han befant seg.
Sjokkerte japanere
Tidlig fredag morgen gikk politiet til aksjon. Gjennom et vindu tok de seg inn i banken og pågrep mannen. Han har allerede innrømmet anklagene mot ham, melder den japanske TV-kanalen NHK.
Det ene gisselet ble behandlet for lettere skader i den ene armen, men alle skal være i god form.
Japansk politi offentliggjorde identiteten til mannen fredag morgen. Han skal være 32 år gammel og arbeidsløs.
Toyokawa er en relativt liten by med 180.000 innbyggere sentralt i Japan, og grov kriminalitet og gisselsituasjoner er veldig uvanlig i Japan. Derfor var lokale innbyggere veldig overrasket da de fikk vite om gisseldramaet.
– Det var sjokkerende. Dette er vanligvis et veldig rolig sted. Noe slikt som dette har aldri tidligere skjedd, sa nabo av banken til NHK.