Tre av de omkomne var amerikanske soldater som var ute for å ta bilder av de høye bølgene på Okinawa.
Den ene av dem er funnet og bekreftet omkommet, mens de to øvrige er savnet.
En 21 år gammel surfer er også savnet og fryktes omkommet utenfor Fujisawa sørvest for Tokyo.
Vindkastene i tyfonen ble målt til opp mot 50 sekundmeter og uværet hadde mandag formiddag kurs for Yokohama sør for Tokyo.
Stor evakuering
600 flyruter måtte innstilles i morgentimene som følge av tyfonen, og veier og jernbaner hadde store problemer. I det sentrale og østlige Japan holder skolene stengt og flere hundre tusen mennesker er evakuert fra utsatte områder.
Uværet fører også til et opphold i letingen etter de 12 som ennå ikke er funnet på vulkanfjellet Ontake, der 51 personer er bekreftet omkommet.