Domstolen i den belgiske hovedstaden Brussel konkluderte onsdag med at Ntuyahaga i tillegg likviderte et ukjent antall rwandiske sivile.
Men han ble frikjent for drapet på Rwandas daværende statsminister Agathe Uwilingiyimana, som de belgiske fallskjermsoldatene skulle beskytte.
Hentet i statsministerboligen
Retten mener Ntuyahaga hentet de fredsbevarende soldatene fra statsministerboligen 7. april 1994 og overleverte dem til soldater i en militærleir i hovedstaden Kigali, der de ble drept.
Statsministeren selv ble drept i sitt eget hjem samme dag.
Hendelsen førte til at Belgia umiddelbart trakk sine fredsbevarende styrker ut av Rwanda.
I løpet av de neste 100 dagene ble over 500.000 tutsier og moderate hutuer drept av ytterliggående hutumilitser. Den belgiske regjeringen har senere innrømmet at mange mennesker kunne ha overlevd hvis de fredsbevarende styrkene ikke hadde reist hjem.
Straffeutmålingen i saken mot den tidligere majoren finner sted torsdag. Han overga seg frivillig til belgiske myndigheter i 2004, og hardnakket hevdet at han er uskyldig.