Det opplyser det irakiske innenriks- og forsvarsdepartementet.
Ifølge NTB inntraff eksplosjonen i det sunnimuslimske distriktet Radwaniya.
Det var en regjeringsstøttet sunnimuslimsk milits som mistet minst tre av sine medlemmer.
Ifølge nyhetsbyrået Reuters var ofrene menn fra den sunnimuslimske Shawa-militsen som kjempet på Al Qaidas side mot USA, men hoppet av i 2006.
Angrepet skjedde da rundt 85 personer sto i kø for å å få utbetalt lønnen sin ved en militærbase i den irakiske hovedstaden.
Ifølge BBC har Shawa-militsen bidratt til å redusere voldsnivået i Bagdad siden de gikk over til å støtte USA i Irak, men gruppen blir med jevne mellomrom angrepet av andre militante grupper.
Den siste tiden har de rapportert om hets fra den irakiske regjeringshæren.