I en seremoni hos den spanske sportsministeren mandag fikk Pereiro overrakt den gule ledertrøyen av Tour-direktør Christian Prudhomme.
21. september ble amerikanske Floyd Landis dømt for dopingmisbruk og fratatt tittelen.
Pereiro var 57 sekunder bak Landis sammenlagt.
- Dette er et følelsesladet øyeblikk, en dag jeg aldri kommer til å glemme, sa Pereiro etter at Tour-direktør Christian Prudhomme ga ham trøyen.
Første gang noen er fratatt tittelen
Det er første gang noen er fratatt seieren i Tour de France.
- Endelig! Det har tatt lang, lang tid. Du er en sen vinner, men en ekte vinner, sa Preudhomme under seremonien.