USA har bedt 60 land om å utvise irakiske diplomater, og mange land har fulgt denne oppfordringen.
Men tyske myndigheter sier de utviser irakerne etter selv å ha funnet beviser for at de har forbrutt seg mot diplomatisk status.
Kort varsel
De fire, som ikke er blitt navngitt, er bedt om å forlate Tyskland på kort varsel, heter det i en kunngjøring fra det tyske utenriksdepartementet.
Den tyske regjeringen sa tidligere denne måneden at den vurderte en forespørsel fra USAs regjering om å utvise et ikke offentliggjort antall irakiske diplomater som den mente kunne utgjøre en fare for amerikansk personell og interesser i Tyskland.
Den tsjekkiske regjeringen har også vedtatt å utvise fire irakiske diplomater, sier Tsjekkias utenriksminister Cyril Svoboda til BBC.
Utenriksministeren sier at de fire må forlate Tsjekkia innen fredag.