Egyptiske sikkerhetsstyrker dro demonstrantene unna, rapporterer nyhetsbyrået AFP.
Ambassaden var tom for folk, siden fredag er en fridag i Egypt. Ingen ble pågrepet.
Syrisk protest
Den syriske ambassadøren kom seg raskt til de ramponerte lokalene, og sa han vil protestere til egyptiske myndigheter som har ansvaret for ambassadens sikkerhet.
- Inntrengerne kom seg helt fram til ambassadørens kontor uten å møte motstand, sa Yusef Ahmed.
Han sa også at syriske regimemotstandere nylig stormet ambassadørboligen, men også den var tom.
- Det er de samme personene som står bak begge angrepene. Vi har gitt egyptiske myndigheter en liste med navn, men de har ikke foretatt seg noe.
Mange drept i Syria i dag
I Syria er minst 56 mennesker drept i dag, fem av dem i byen Aleppo hvor det hittil har vært rolig.
Det opplyser eksilorganisasjonen Syrias menneskerettighetsobservatorium.
Sikkerhetsstyrkene skal ha drept tilsammen 23 mennesker flere steder i landet. 19 av dem i Nawa, fem i Aleppo, 15 i Homs, en i nabobyen Hama, mens tilsammen to barn og tok voksne ble drept i to hendelser i nærheten av hovedstaden Damaskus.
Avhoppere fra hæren drepte i tillegg 12 medlemmer av sikkerhetsstyrkene. Seks av dem mistet livet da desertører gjennomførte et bilbombeangrep mot en kontrollpost i byen Idlib. Seks andre ble drept i provinsen Daraa da avhoppede soldater angrep to busser med sikkerhetspersonell.
Dermed er over 100 mennesker drept bare de to siste dagene.
- Vanskeliggjør samtaler
Lederen for observatørene fra Den arabiske liga, den sudanske generalen Mohammed Ahmed Mustafa al-Dabi, sier at volden har tiltatt de siste dagene dagene, spesielt i byene Homs, Hama og Idlib.
- Volden bidrar ikke til å legge forholdene til rette for samtaler, sier han.
