Holkeri, som skulle sittet i stillingen til august, oppga på en pressekonferanse i Helsingfors helseproblemer som grunn for å gå av. Han skal være sliten og har nylig vært innlagt på sykehus i Strasbourg.
Det er ikke klart hvem som etterfølger ham som FN-sjef i Kosovo. Nestleder for FN-administrasjonen er amerikaneren Charles Brayshaw.
Holkeri har tidligere vært statsminister i Finland. Han har deltatt i fredsprosessen i Nord-Irland og vært president i FNs hovedforsamling.
Serbia har krevd at NATO og FN gjør mer for å garantere sikkerheten til de rundt 100.000 serberne som fortsatt bor i Kosovo, og har krevd at Holkeri går av. Den amerikanske Balkan-eksperten Richard Holbrooke har beskyldt Holkeri for ikke å forstå situasjonen i Kosovo.