Dette bekrefter en agent i flyselskapet, ifølge Russia Today.
Opplysningene blir støttet av journalisten Max Seddon fra Associated Press som har booket et flysete ved siden av der Snowden skulle sitte. Han melder på Twitter: «he ain't here».
Ifølgje journalister på Twitter har mellom 20 og 30 journalister booket seg inn på flyet i håp om å få Snowden i tale.
I går ble det kjent at Edward Snowden dro fra Hongkong til Moskva. Han skal ha overnattet i transit-sonen på Moskva-flyplassen, da han ikke hadde gyldig russisk visum.
Det var lenge full forvirring om hans neste destinasjon, men etterhvert kom det meldinger om at han ville dra til Ecuador for å søke politisk asyl.
– Sannsynligvis ikke i Russland
Meldingene i går kveld gikk ut på at han ville ta dagens ettermiddagsfly til Havana, der han sannsynligvis hadde tenkt å mellomlande på vei til Ecuador.
Foreløpig er det ingen indikasjoner på hvor Edward Snowden nå befinner seg. Det neste flyet fra Moskva til Havana skal gå klokken 18.50, norsk tid.
Ifølge det russiske nyhetsbyrået Interfax skal Snowden også ha kjøpt en billett på det neste flyet. Men det er mye som tyder på at dette også er en avledningsmanøver.
De siste meldingene fra Interfax sier at Snowden mest sannsynlig er utenfor landet, ifølge en ukjent kilde.
Det hvite hus ba mandag morgen russiske myndigheter utlevere 30-åringen, men russiske myndigheter skal ha sagt nei.
Det er fortsatt ukjent hvorfor Snowden valgte å forlate Hongkong på søndag. Ifølge myndighetene Hongkong forlot han landet frivillig, da landet tidligere publiserte en pressemelding der de besluttet å avstå fra å utlevere Snowden til USA.
Men Snowdens advokat i Hongkong, Albert Ho, sa til BBC at en myndighetsperson hadde oppfordret Snowden om dra i løpet av helgen. Advokaten trodde denne personen handlet på vegne av sentrale kinesiske myndigheter i Beijing.
Ecuadors utenriksminister melder på Twitter at han vil avholde en pressekonferanse klokken 14, norsk tid, der han vil redegjøre nærmere for Snowdens asylsøknad.