Tyskeren trosset det øsende regnet og kjørte den 5,807 kilometer lange runden på 1.47,906, klart foran Giancarlo Fisichella fra Italia (1.48,362) og Ferrari-lagkamerat Rubens Barrichello (1.49,846).
Også i den andre treningsrunden var tyskeren best, men både han og kollegene slet med de tøffe forholdene. Regnet ble kraftigere og sikten dårligere etter hvert som timene gikk.
- Det var umulig å kjøre, sa Schumacher etter ettermiddagens runde
Tyfon
På grunn av en ventet tyfon er lørdagens kvalifisering er utsatt til søndag morgen, noen timer før VM-runden starter.
VM-arrangøren opplyste at japanske myndigheter hadde bedt dem stenge banen helt. Førerne reagerte med lettelse på at kvalifiseringen blir utsatt.
- Det er utrolig farlig å kjøre med så mye vann på banen. Hvis noen planer på de rette strekkene, kan det få fatale følger, mener britiske Jenson Button.
Tyfonen Ma-on, som innen fredag kveld ikke hadde truffet land, har bygd seg opp i styrke til en supertyfon. Men det er ventet at været vil bedre seg betraktelig med en gang den har passert.