Britiske Emma Ania på annenplass løp inn til 11,59 i nesten en sekundmeters medvind.
Tredjeplassen i søndagens løp gikk til Jones' lagvenninne Angela Williams. Hun fikk 11,60.
Jones er tilbake igjen for fullt etter skader og problemer rundt BALCO-affæren, der både hun og partneren Tim Montgomerie var innblandet.
- Forholdene var ikke slik at det kunne bli noen topptid. Det sier jeg ikke som noen unnskyldning, men det er bare slik det er, sa Jones som har en personlig rekord på sterke 10,65 sekunder.
Brukbar start
- Starten min var god her i Hengelo. Ikke like god som i Mexico, da jeg løp på 11,06 for 14 dager siden, men brukbar. Derfor er jeg fornøyd med løpet mitt, sa den amerikanske sprinteren.
Veronica Campbell fra Jamaica har den raskeste 100 meteren i verden denne sesongen med 10,99.
Jones har tidligere i år 11,06 som best, fra Xalapa 13. mai.
Søndagens Grand Prix-stevne i Hengelo var Jones' første i Europa denne sesongen.
Ikke avskrekkende
På 5000 meter for kvinner gikk etiopiske Meseret Defar til topps med 14.35,37.
Hun kommer til Bislett om fem dager for å løpe den samme distansen mot Susanne Wigene.
Tiden fra Hengelo er ikke avskrekkende, heller ikke for Wigene som har som mål å løpe på under 15 minutter i sesongdebuten på distansen.
Svenske Stefan Holm var eneste skandinav i Hengelo-stevnet. Han tok tredjeplassen i høyde med temmelig ordinære 2,26 meter.