Ahmad Arafat ble skutt i brystet i flyktningleiren Jelazoun nær Ramallah, etter at de israelske soldatene hadde rykket inn for å ta fanger.
19-åringen ble løslatt fra et israelsk fengsel for bare en uke siden, men det er uklart om han var et av målene for nattens aksjon.
Israelske styrker har tatt minst 80 palestinere til fange siden torsdag, da tre israelske tenåringer ble bortført fra en bosetning på Vestbredden.
Israel anklager Hamas for å ha bortført de tre, noe islamistgruppen benekter.
Haiket
De tre tenåringene forsvant torsdag idet de haiket fra Betlehem til Hebron på den israelsk-okkuperte Vestbredden.
To av de tre er 16 år gamle, mens den tredje er 19 år, skriver den israelske avisen Haaretz. En av tenåringene er også amerikansk statsborger.
De tre tenåringene går alle på skole i de folkerettsstridige jødiske bosettingene på Vestbredden.