Det bekrefter det sørkoreanske militæret mandag morgen norsk tid.
– Han skjøt seg selv i siden og vi har fanget ham i live, forteller en talsmann for det sørkoreanske forsvarsdepartementet til nyhetsbyrået AFP.
Skadene han pådro seg selv skal ifølge BBC ha vært et mislykket forsøk på selvmord. Soldaten er nå fraktet til sykehus.
Tusener av soldater støttet av spesialstyrker og helikoptre hadde omringet den væpnede 23 år gamle sersjanten etter en lang natt i fastlåst stilling i et lite skogkledd område sør for den tungt bevoktende grenselinja.
– Vi har kommet helt innpå ham, og han har vært nær nok til å plukke opp en mobiltelefon vi kastet til ham, sa talsmann for forsvarsdepartementet, Kim Min-soek søndag.
Forhandlet
Kim sier at soldaten hadde snakket med sin far på mobilen, og at faren ba ham om å overgi seg.
Men han viste ingen tegn til å overgi seg etter hvert som forhandlingene trakk ut, og han skjøt attpåtil flere ganger mot soldatene som jaktet på ham.
Søndag sa Kim at det ikke forelå planer om å ta ham med makt med det første, og at de foretrekker å forhandle.
Mobbing
Det er fortsatt uklart hvorfor soldaten åpnet ild mot sine medsoldater i en leir i Goseong, 220 kilometer nordøst for Seoul, før han rømte med en K-2-rifle og en større mengde ammunisjon.
Men militære kilder sier at han hadde problemer med å tilpasse seg det militære, og at psykologer hadde bedt hans overordnede passe spesielt på ham.
Mobbing er utbredt i sørkoreanske militærleirer og har fått skylden for flere selvmord og tilfeller av skyting tidligere.
I 2011 skjøt en 19 år gammel soldat fire medsoldater, og i 2005 ble åtte soldater drept og to alvorlig såret da en 22 år gammel soldat kastet en granat og skjøt vilt mot sovende kolleger på en vaktpost ved grensa.