Et overvåkingsfly oppdaget undervannsbåten vel 200 kilometer sør for feriebyen Huatulco.
Det ble dermed satt i gang jakt på fartøyet, forteller kontreadmiral Hector Mucharraz.
Ombygd fartøy
Marinesoldater slo til da ubåten kom til overflaten. Soldatene bordet ubåten fra et helikopter og overmannet mannskapet på fire.
Den grønnmalte undervannsbåten var om lag 10 meter lang og virket som et ombygd fartøy.
Ubåt for første gang
Mexico bruker i stigende grad militære mannskaper i kampen mot voksende narkokriminalitet.
Smuglerne har brukt mange fantasifulle metoder for å smugle narkotika inn i USA, men det er første gang marinen har beslaglagt en smuglerubåt.