Overgangen blir bekreftet gjennom en offisiell uttalelse på Borussia Dortmunds facebook-sider.
Götze har skrevet under en treårskontrakt med Bayern München, som allerede har vunnet den tyske serien. Dortmund går mot en sikker annenplass. Begge lagene skal spille semifinaler i Mesterligaen denne uken.
Götze ble seriemester med Borussia Dortmund i 2011 og 2012.
20-åringen regnes for å være blant Tysklands største fotballtalenter, og har vært på ønskelisten til flere europeiske storklubber.