Huber etterfølger Edmund Stoiber, som har styrt det velstående Bayern i 14 år, men som ble tvunget til å gå av etter en skandale som skjøt fart i vinter.
CSUs glamorøse partimedlem Gabriele Pauli beskyldte Stoiber for å ha latt medarbeidere spionere på henne.
Innenriksminister Günther Beckstein er valgt til å etterfølge Stoiber som statsminister i delstaten Bayern.