Funnet ble gjort ved en militærbase sør i Tripoli som nylig ble forlatt av Gaddafis elitesoldater.
Menneskene som er funnet, ser ut til å være likvidert tidligere i uken, ifølge TV-stasjonen Sky News.
Skutt og påtent
Det var lokale innbyggere i tripoli som fant likene etter at opprørerne tok kontroll over basen, som tidligere ble brukt av elitesoldater som ledes av Gaddafis sønn Khamis.
– Jeg er sjokkert, jeg hadde aldri forestilt meg at jeg ville få se noe sånt i Libya, sier doktor Salim Rajub, som bor like ved basen, til nyhetsbyrået AFP.
Han mener likene ble drept i massakren som fant sted tirsdag. De drepte skal ha vært motstandere av Gaddafi som ble likvidert da regimet hans raknet. Ofrene skal ha blitt skutt og deretter påtent
– 23. august hørte vi skudd og folk som ropte på hjelp, men det var snikskyttere utenfor og ingen kunne gå nærmere, sier han.
- Les også:
Over 50 lik
Beboerne som fant likene, sier at det var til sammen 53 lik i bygningen, mens en av AFPs korresponderer sier han så 50 lik.
Lokalbefolkningen dekket over levningene etter at opprørsstyrker tok kontroll over basen i Salaheddin-distriktet denne uken.
– Dette ser ut som et massedrap, sier Sky News' reporter Stuart Ramsay, som sier han har talt likene i det utbrente lagerhuset sør i Tripoli.
Klarte å rømme
Det er uklart om de drepte var sivile eller soldater, men en mann som skal ha overlevd hendelsen, forteller til Sky News at han klarte å rømme.
– Ti-elleve personer klarte å rømme. De forsøkte å drepe dem til og med da de rømte, sier han.
Ifølge lokalbefolkningen kan mange andre drepte ligge begravd i bygningskomplekset eller i nærliggende bygninger og lagerhus.