Etter at høringen en stund ble avbrutt av demonstranter som protesterte mot den omstridte dronebruken, understreket Brennan at droner er en avgjørende siste utvei for å forsvare USAs sikkerhet rundt om i verden.
Brennan, som regnes for å være arkitekten bak droneprogrammet, måtte håndtere gjentatte spørsmål om de såkalte målrettede likvideringene, som også har rammet amerikanske statsborgere.
Flere demokratiske senatorer krevde mer åpenhet fra Det hvite hus om programmet og mer informasjon både til dem og til velgerne.
– Å ta opp kampen med al-Qaida er noe vi alle føler sterkt for. Men at presidenten skal ha frie tøyler til å drepe amerikanere uten lov og dom, er det som er så bekymringsfullt, sa senator Ron Wyden til Brennan.
Brennan gjorde det klart at droner bare settes inn for å redde liv, og at myndighetene gjør det aller beste de kan for å unngå at andre skades.
57 år gamle Brennan satt i toppledelsen i CIA under tidligere president George W. Bush, og har de siste fire årene vært Obamas fremste terrorrådgiver.
Nå ventes han å få jobben, men først må han godkjennes av Senatet, der han først og fremst blir grillet av demokratiske partifeller. Han vil i så fall etterfølge general David Petraeus, som måtte gå av etter en utroskapsaffære.
- Les også:
Artikkelen fortsetter.
Avbrutt av protest
Høringen hadde så vidt kommet i gang da den ble avbrutt av demonstranter som protesterte mot dronekrigen i Nordvest-Pakistan, Jemen og Somalia.
Da Brennan skulle til å lese opp sitt åpningsinnlegg, reiste flere demonstranter seg i salen én etter én og begynte å rope. Idet den første demonstranten var ført ut av salen, reiste en ny demonstrant seg opp.
– Jeg snakker på vegne av mødre i Pakistan, Somalia og mange andre steder, ropte en av demonstrantene.
Da Brennan ble avbrutt for femte gang, slo senator Dianne Feinstein, som leder komiteen for etterretningssaker, klubben i bordet og beordret at salen måtte tømmes. Kort tid etter var alle demonstranter fjernet, og høringen kunne gjenopptas.
- Les også:
Artikkelen fortsetter.
Skepsis
Praksisen møtes med stadig større skepsis av menneskerettsgrupper og også av amerikanske militære, som mener den utløser unødvendige sinne mot USA.
FN kunngjorde i januar at 25 amerikanske droneangrep i Pakistan, Jemen, Somalia og Afghanistan skal granskes etter kritikk fra blant annet menneskerettsorganisasjoner, som mener de ikke bare rammet militante islamister, men også uskyldige sivile.
Det er uklart hvor mange sivile som er rammet, men New York Times mener å ha tall som viser at 80 uskyldige sivile er blant de 400 som er drept i Jemen. Til sammen er over 3.000 mennesker drept av droner i Obamas første periode.
Men Det hvite hus mener bruken av droner både er legitim og etisk, og holder fast ved at den er i overensstemmelse med amerikansk lov.
Dagen før høringen bøyde Obama seg for presset og ga senatorene de klassifiserte retningslinjene for når amerikanske statsborgere kan drepes.
Waterboarding
I høringen ble Brennan også grillet om torturlignende avhørsteknikker som waterboarding, eller simulert drukning, da han jobbet for CIA tidligere i karrieren.
Han sa han ikke hadde prøvd å stanse bruken av waterboarding da han jobbet for CIA tidligere i karrieren. Men at han personlig var imot og hadde gjort det klart, selv om han ikke gikk med på at det er tortur.
– Jeg tok ikke skritt for å stanse CIAs bruk av disse teknikkene. Jeg var ikke i kommandokjeden til det programmet, sa Brennan.
– Men jeg ga uttrykk for mine personlige motforestillinger og mitt synspunkt om simulert drukning, om nakenhet og andre ting overfor noen av mine kolleger. Men jeg forsøkte ikke å stoppe det, for det var noe som foregikk i en annen del av byrået. Og det var noe som var klarlagt med administrasjonen på den tiden, sa Brennan.