Den er første gang Russland innrømmer at landets allierte, Bashar al-Assad, ser ut til å tape kampen mot opprørerne.
Les også:
Veto i FN
Viseutenriksministeren sier imidlertid ikke noe om hvorvidt dette også betyr at Russland kan forandre sin holdning i FN, der russerne to ganger, sammen med Kina, har lagt ned veto mot å innføre sanksjoner mot regimet.
Ifølge nyhetsbyrået Associated Press tyder uttalelsen på at Russland er i ferd med å posisjonere seg for et mulig maktskifte i Damaskus.
– Vi må se på fakta. Det er en tendens til at regimet mister mer og mer makt over en stadig større del av landet. En seier til opposisjonen kan ikke utelukkes, sier Bogdanov.
– Kampene vil bli hardere
Samtidig gjentar han Russlands oppfordring til partene om å inngå et kompromiss, og sier at det ennå vil ta lang tid for opposisjonen å beseire regimet.
– Kampene vil bli enda hardere, og flere ti tusen, kanskje flere hundre tusen mennesker kan bli drept.
– Dersom dere mener at det er en akseptabel pris for å styrte en president, hva kan vi gjøre? Vi mener selvsagt at en slik pris er totalt uakseptabel, sier Bogdanov.
Han sier også at Russland jobber med planer om å evakuere russiske statsborgere fra Syria dersom det skulle bli nødvendig.
Les også:
Torsdag formiddag ble 16 mennesker drept, sju av dem barn, da en bilbombe eksploderte i byen Qatana, sørvest for hovedstaden Damaskus.
Det opplyser regimet, som legger skylden for angrepet på «terrorister», en vanlig betegnelse på opprørerne.